Pioneer Culture to the Rescue of Mankind (فرهنگ پيرو، فرهنگ پيشرو)
تعريف فرهنگ در اين كتاب به راه حل اساسي خود نزديك شده و با تامل در لغتنامه ها و انگارههاي علمي ملل و اقوام مختلف ، نظریه جديد و مناسبي توسط استاد جعفري به كاروانيان دانش و بينش پيشنهاد شده است. علاوه بر این، تعریف جامعی است که در« فرهنگ پیرو، فرهنگ پیشرو» از ماهیت فرهنگی به عمل آمده، به برخی مجادلات و اختلاف نظرهای کلامی و نظری محض در خصوص فهم علمی فرهنگ پایان داده است.

The Mystery of Life (معمای حیات)
این کتاب ـ به صورت خلاصه ـ کتابی است که به بررسی و با تحلیل روزآمد حقیقت انسان، خدا، دین، هستی، معرفت، تکاپو، حقیقت طلبی، اقتصاد، سیاست، فرهنگ، اخلاق، سنت، مدرنیته و مقولاتی از این دست، می کوشد نظریه جامعی پیش روی انسان شرقی و غربی قرار دهد.
این اثر، منتخب و گزیده آراء استاد جعفری در 21 محور است که به بررسی مسائل شرق و غرب در زمینه طبیعت، ماوراء طبیعت، عقلانیت و جستار در اصول ثابت و متغیر پرداخته، و در یک کلام: در صدد پی افکندن شیوه های جدید در برداشت از مسائل جاری حیات است که با زبانی علمی و ملایم نگارش یافته است. از ویژگی های عمده این اثر، دارابودن آن به سؤالات اصلی بشر است، با پاسخ هایی که می کوشد اصالت ها را فرایاد بیاورد.

The Conscience (وجدان)
در اين اثر، وجدان در درياي پرتلاطم شخصيت انسان از ابعادي چون : اخلاق ، تاريخ ، دين و روان شناسي تشريح مي گردد و نتيجه اين مي شود كه : وجدان منعكس كننده صداي خداوندي بوده و تا انسانيت مورد نياز است ، به وجدان نيز محتاج خواهيم بود.
در اين كتاب ، وجدان از چندين جنبه گوناگون مورد بررسي قرار گرفته، نكات جديدي درباره آن اظهار شده است كه در بازشناسي قلمروهاي آن كمك شاياني مي كند. در واقع ، در كتاب مزبور، وجدان با تفسير جديدي تعريف شده و نكات تازه اي از ابعاد آن روشن شده است ، كه مي توان گفت: كمك فراوانی در تحديد مباني اخلاق ساز آن نموده، مجهولاتي عمده را حل و فصل مي نمايد.

Positive Mysticism(عرفان اسلامي)
كتابي است كه به تشريح و توضيح مقوله عرفان از ديدگاه اسلام راستين پرداخته، مؤلفه هاي زندگي امروزين بشر را از دريچه عرفان پويا و مثبت مورد كنكاش قرار داده است . بخش هاي مهم اين كتاب را بحث هاي زير تشكيل مي دهد: عرفان و نظم ، عرفان و كار، عرفان و علم ، عرفان و دين ، عرفان و اخلاق ، عرفان و موسيقي...

علی اجنحه الروح (نيايش امام حسين(ع) در صحراي عرفات)
اين كتاب، يكي از متون اسلامي در زمينه دعا و چند و چون نيايشي خالصانه به بارگاه الهي است. قلم روان و نثر زيبا، سبب شده كه محمدتقی جعفري بيانات مبارك امام حسين(ع) را در صحراي عرفات با روشي نوين و كارساز شرح نموده، به بازکاوی و تبیین ابعاد آن بپردازد.

همگرایی دین و دانش (تعاون الدین و العلم)
کتابی است تحقیقی پیرامون علم و دین که به بررسی ماهیت دین و نیز مرزهای گسترده دانش در عرصه های مختلف بشری و نیز نظریه های ابراز شده در خصوص حقیقت علم، اندیشه و فلسفه می پردازد. در این اثر، فرضیه ها و قوانین مورد بازکاوی قرار گرفته، نمادهای مطلق با تفسیری روشن ارائه شده است.